ComputeBuilder AI
クリーンUbuntuからGROMACSのGPU計算へ：ComputeBuilder AIで構築からSlurmまで
DGX Spark上のComputeBuilder AIに日本語で相談し、RTX PRO 6000 Blackwellのドライバー、CUDA、GROMACS、Slurmを構築。10個のプロンプト、実測結果、AIと内蔵手順の役割を動画とともに紹介します。
HPC・科学計算
HPC・科学計算の記事一覧
ComputeBuilder AI
日本語でGPU計算サーバーを構築する：ComputeBuilder AI実機検証
DGX Spark上のComputeBuilder AIに日本語で相談し、クリーンなUbuntuからH100×2のドライバー、HPC SDK、Quantum ESPRESSO、Slurmを構築。全8プロンプト、途中の失敗と修正、2GPU同時実行の根拠を動画とともに紹介します。
DeepSeek V4.1 Flash
DeepSeek V4.1 Flash、約0.42ドルでFortranを最大39.653倍高速化――7モデル完全ブラインド比較
DeepSeek V4.1 Flashへ3本の公開Fortranコードを各32分23秒、完全ブラインドで高速化させた。最大39.653倍、3本総合22.029倍で7モデル中3位。推定API費用は3本合計約0.42ドルだった。
HPC・科学計算
GPU化の前に、CPUだけで約19.3倍高速化：近畿大学の研究用Fortranコード最適化事例
近畿大学の研究用Fortranコードを、Intel oneAPI MKL、OpenMP、計算条件間の依存関係を保った並列分割、CPUコアとメモリの配置、出力統合の改善により、同一40コア環境で399.60秒から20.73秒へ、約19.3倍高速化した事例です。
HPC・科学計算
今年４月にリリースされたubuntu 24.04 LTSを使いHPC Clusterを構築する
この記事は未完成です。完成まで少しお待ちください。 今年４月にリリースされたUbuntu 24.04 LTSを使いHPC Clusterを構築します。この記事を書くに至った理由は次のとおりです。 私のお客様でHPC Clusterをお使いの方は何人かいらっしゃいますが、その中にCentOS 6.3の時代にHPC...
HPC・科学計算
SlurmをインストールしてGPU使用のジョブをスケジューリングする
以前の記事ではGPUがない場合の、Slurmのインストールと設定と使用方法を解説しましたが、この記事では8GPUのサーバーにSlurmのインストールと設定を行います。設定ファイルの自動生成のスクリプトの紹介も行っていますので、これを使えばGPUサーバーでのSlurmの設定も簡単に行うことができます。その後、tf...
HPC・科学計算
JOB Scheduler Slurmのインストールと使い方
JOB Schedulerの中でHPC環境で非常に人気のあるSlurmのインストールlと設定を行い、Intel MPIのジョブを流してみます。OSはUbuntu...
HPC・科学計算
Intel oneAPIをインストールしてIntel MPIを使う
IntelのMPIはFreeのOpenMPIなどに比べて高性能と言われてきました。しかし少し前まではIntel MPIは有償でそれなりに高額なので、OpenMPIとの性能差を気軽に確かめることはできませんでした。現在は無償でダウンローと可能なintel oneAPIの中にIntel...
HPC・科学計算
Genoa２ノードInfinibandクラスター
AMDの最新CPU、Genoaを搭載する２台のサーバーに200GbpsのInfinibandカードを搭載し、Infinibandクラスターを構築した。Infiniband Driverをインストールし、Subnet...
HPC・科学計算
Virtual HPC Cluster USBの使い方
本Blogで連載の「HPC Cluster構築」の手順に従って作成した、Virtual HPC Cluster USBの使い方を説明します。 USBメモリをノートPC、デスクトップPC、ワークステーション、サーバーなどに差し込んで、Boot Deviceとして選択して立ち上げます。
HPC・科学計算
プレゼント: Virtual HPC Cluster USB （第28回計算工学講演会にて）
Virtual HPC Cluster USBを第28回計算工学講演会（つくば国際会議場）でアンケート記入で無料プレゼントします。
HPC・科学計算
HPCクラスター構築（その10）最終回
これまでHPC Clusterの構築方法と簡単な使い方を解説してきましたが、Virtualbox上でのことでした。Virtualboxでは所詮１台のコンピュータ上で仮想のクラスターをシミュレーションしているので、性能などには限界があります。Real...